アニポケ新無印シリーズが悪評であった理由は、以下のような点が挙げられます。
1. 絵柄やアニメーションの変更：これまでのポケモンアニメと比較して、アニポケ新無印シリーズはキャラクターデザインやアニメーションが変更されました。この変更に対して、従来のアニメを慣れ親しんできた視聴者からは違和感や不評などの声があがりました。
2. ストーリーの進行：アニポケ新無印シリーズは、ポケットモンスターサン＆ムーンシーズン同様、従来のポケモンアニメと比べてストーリーが進行しないという批判もありました。ストーリーの展開がゆっくりとしたため、セリフや場面が繰り返し表示されることで、退屈さを覚える視聴者もいました。
3. キャラクターの性格の変化：アニポケ新無印シリーズでは、アニメオリジナルのキャラクター設定やポケモンの性格が変更されたことが批判の要因となりました。ポケモンの可愛らしさやキャラクターの魅力が失われたと感じる視聴者がいたためです。
4. 伝承エピソードの省略：ポケモンアニメには、各地方ごとの伝承エピソードがありますが、アニポケ新無印シリーズではこれらのエピソードが省略されたことが批判を受けました。従来のアニメとの違いに違和感を覚える視聴者が多かったと言えます。
